Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
APOBEC3AP31941 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APOBEC3AP31941 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
APOBEC3AP31941 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
APOBEC3AP31941 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms