Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
KDM5AP29375 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
KDM5AP29375 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
KDM5AP29375 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
KDM5AP29375 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
KDM5AP29375 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.61
KDM5AP29375 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
KDM5AP29375 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KDM5AP29375 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
KDM5AP29375 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
KDM5AP29375 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
KDM5AP29375 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
KDM5AP29375 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
KDM5AP29375 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
KDM5AP29375 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
KDM5AP29375 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
KDM5AP29375 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
KDM5AP29375 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
KDM5AP29375 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
KDM5AP29375 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
KDM5AP29375 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
KDM5AP29375 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
KDM5AP29375 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
KDM5AP29375 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
KDM5AP29375 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
KDM5AP29375 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
KDM5AP29375 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
KDM5AP29375 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
KDM5AP29375 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
KDM5AP29375 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
KDM5AP29375 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
KDM5AP29375 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
KDM5AP29375 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
KDM5AP29375 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
KDM5AP29375 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
KDM5AP29375 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
KDM5AP29375 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
KDM5AP29375 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
KDM5AP29375 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5AP29375 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5AP29375 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
KDM5AP29375 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
KDM5AP29375 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
KDM5AP29375 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
KDM5AP29375 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
KDM5AP29375 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
KDM5AP29375 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
KDM5AP29375 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
KDM5AP29375 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
KDM5AP29375 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
KDM5AP29375 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
KDM5AP29375 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
KDM5AP29375 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
KDM5AP29375 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
KDM5AP29375 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
KDM5AP29375 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
KDM5AP29375 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
KDM5AP29375 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
KDM5AP29375 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
KDM5AP29375 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms