Protein–RNA interactions for Protein: P29122

PCSK6, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 6, humanhuman

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK6P29122 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK6P29122 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PCSK6P29122 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK6P29122 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK6P29122 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK6P29122 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCSK6P29122 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCSK6P29122 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCSK6P29122 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCSK6P29122 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK6P29122 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK6P29122 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCSK6P29122 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK6P29122 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK6P29122 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK6P29122 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCSK6P29122 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCSK6P29122 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCSK6P29122 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCSK6P29122 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCSK6P29122 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms