Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRB3P28472 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRB3P28472 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GABRB3P28472 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GABRB3P28472 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GABRB3P28472 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GABRB3P28472 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GABRB3P28472 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRB3P28472 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRB3P28472 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRB3P28472 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABRB3P28472 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRB3P28472 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABRB3P28472 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRB3P28472 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABRB3P28472 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABRB3P28472 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRB3P28472 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABRB3P28472 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms