Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD1P28289 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD1P28289 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD1P28289 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TMOD1P28289 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD1P28289 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD1P28289 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD1P28289 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD1P28289 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TMOD1P28289 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD1P28289 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
TMOD1P28289 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TMOD1P28289 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD1P28289 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD1P28289 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD1P28289 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TMOD1P28289 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TMOD1P28289 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMOD1P28289 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMOD1P28289 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TMOD1P28289 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD1P28289 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD1P28289 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD1P28289 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMOD1P28289 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD1P28289 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD1P28289 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMOD1P28289 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMOD1P28289 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMOD1P28289 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMOD1P28289 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TMOD1P28289 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMOD1P28289 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMOD1P28289 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms