Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTX3P26022 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTX3P26022 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTX3P26022 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTX3P26022 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTX3P26022 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTX3P26022 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTX3P26022 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTX3P26022 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTX3P26022 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTX3P26022 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTX3P26022 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTX3P26022 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTX3P26022 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTX3P26022 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTX3P26022 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTX3P26022 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTX3P26022 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTX3P26022 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTX3P26022 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PTX3P26022 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTX3P26022 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTX3P26022 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTX3P26022 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PTX3P26022 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTX3P26022 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTX3P26022 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTX3P26022 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTX3P26022 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTX3P26022 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PTX3P26022 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTX3P26022 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTX3P26022 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTX3P26022 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTX3P26022 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PTX3P26022 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PTX3P26022 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTX3P26022 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PTX3P26022 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTX3P26022 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTX3P26022 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTX3P26022 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTX3P26022 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTX3P26022 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTX3P26022 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTX3P26022 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTX3P26022 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTX3P26022 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTX3P26022 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTX3P26022 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTX3P26022 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTX3P26022 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTX3P26022 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTX3P26022 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTX3P26022 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTX3P26022 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTX3P26022 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTX3P26022 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTX3P26022 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTX3P26022 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTX3P26022 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTX3P26022 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTX3P26022 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTX3P26022 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTX3P26022 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTX3P26022 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTX3P26022 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTX3P26022 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PTX3P26022 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTX3P26022 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTX3P26022 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTX3P26022 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTX3P26022 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTX3P26022 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTX3P26022 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTX3P26022 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PTX3P26022 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTX3P26022 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTX3P26022 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTX3P26022 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTX3P26022 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PTX3P26022 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTX3P26022 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTX3P26022 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTX3P26022 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTX3P26022 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTX3P26022 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTX3P26022 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTX3P26022 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTX3P26022 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTX3P26022 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTX3P26022 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTX3P26022 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTX3P26022 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTX3P26022 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTX3P26022 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTX3P26022 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTX3P26022 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTX3P26022 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTX3P26022 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms