Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTAFRP25105 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTAFRP25105 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTAFRP25105 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PTAFRP25105 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTAFRP25105 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms