Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CXCR1P25024 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CXCR1P25024 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CXCR1P25024 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CXCR1P25024 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms