Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRPH2P23942 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRPH2P23942 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRPH2P23942 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRPH2P23942 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRPH2P23942 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.3 ms