Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EIF4BP23588 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EIF4BP23588 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EIF4BP23588 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
EIF4BP23588 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
EIF4BP23588 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms