Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME2P23368 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME2P23368 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME2P23368 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME2P23368 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME2P23368 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ME2P23368 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME2P23368 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME2P23368 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME2P23368 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME2P23368 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME2P23368 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME2P23368 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME2P23368 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME2P23368 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ME2P23368 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ME2P23368 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME2P23368 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME2P23368 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ME2P23368 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME2P23368 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME2P23368 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME2P23368 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME2P23368 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME2P23368 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME2P23368 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME2P23368 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME2P23368 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME2P23368 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME2P23368 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ME2P23368 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME2P23368 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME2P23368 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME2P23368 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME2P23368 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME2P23368 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ME2P23368 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME2P23368 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME2P23368 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME2P23368 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME2P23368 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ME2P23368 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME2P23368 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME2P23368 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME2P23368 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ME2P23368 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME2P23368 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ME2P23368 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME2P23368 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME2P23368 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ME2P23368 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME2P23368 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME2P23368 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME2P23368 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME2P23368 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ME2P23368 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME2P23368 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ME2P23368 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME2P23368 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME2P23368 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ME2P23368 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME2P23368 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ME2P23368 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ME2P23368 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME2P23368 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ME2P23368 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME2P23368 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME2P23368 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME2P23368 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ME2P23368 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME2P23368 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ME2P23368 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME2P23368 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ME2P23368 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME2P23368 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME2P23368 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ME2P23368 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME2P23368 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME2P23368 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME2P23368 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME2P23368 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME2P23368 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME2P23368 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ME2P23368 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME2P23368 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ME2P23368 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME2P23368 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME2P23368 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME2P23368 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ME2P23368 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ME2P23368 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ME2P23368 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ME2P23368 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ME2P23368 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME2P23368 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME2P23368 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME2P23368 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ME2P23368 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ME2P23368 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ME2P23368 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms