Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RASA1P20936 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RASA1P20936 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RASA1P20936 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RASA1P20936 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RASA1P20936 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RASA1P20936 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RASA1P20936 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RASA1P20936 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RASA1P20936 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RASA1P20936 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RASA1P20936 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
RASA1P20936 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RASA1P20936 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RASA1P20936 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RASA1P20936 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RASA1P20936 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RASA1P20936 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RASA1P20936 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
RASA1P20936 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
RASA1P20936 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RASA1P20936 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RASA1P20936 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RASA1P20936 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RASA1P20936 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RASA1P20936 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RASA1P20936 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RASA1P20936 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RASA1P20936 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RASA1P20936 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RASA1P20936 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RASA1P20936 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RASA1P20936 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RASA1P20936 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RASA1P20936 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RASA1P20936 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RASA1P20936 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RASA1P20936 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RASA1P20936 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RASA1P20936 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RASA1P20936 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RASA1P20936 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RASA1P20936 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RASA1P20936 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
RASA1P20936 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RASA1P20936 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RASA1P20936 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RASA1P20936 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RASA1P20936 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RASA1P20936 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
RASA1P20936 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RASA1P20936 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RASA1P20936 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RASA1P20936 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RASA1P20936 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RASA1P20936 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RASA1P20936 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RASA1P20936 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RASA1P20936 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RASA1P20936 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RASA1P20936 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
RASA1P20936 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
RASA1P20936 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RASA1P20936 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RASA1P20936 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RASA1P20936 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RASA1P20936 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RASA1P20936 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RASA1P20936 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RASA1P20936 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RASA1P20936 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RASA1P20936 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RASA1P20936 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RASA1P20936 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RASA1P20936 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RASA1P20936 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RASA1P20936 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RASA1P20936 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RASA1P20936 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RASA1P20936 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RASA1P20936 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RASA1P20936 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RASA1P20936 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
RASA1P20936 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
RASA1P20936 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RASA1P20936 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RASA1P20936 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RASA1P20936 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RASA1P20936 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RASA1P20936 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RASA1P20936 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RASA1P20936 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RASA1P20936 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RASA1P20936 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RASA1P20936 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RASA1P20936 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RASA1P20936 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
RASA1P20936 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RASA1P20936 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RASA1P20936 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms