Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4BPBP20851 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4BPBP20851 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BPBP20851 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C4BPBP20851 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms