Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARF4P18085 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ARF4P18085 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARF4P18085 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARF4P18085 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ARF4P18085 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ARF4P18085 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ARF4P18085 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARF4P18085 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ARF4P18085 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARF4P18085 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARF4P18085 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ARF4P18085 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ARF4P18085 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARF4P18085 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ARF4P18085 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARF4P18085 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ARF4P18085 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARF4P18085 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARF4P18085 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ARF4P18085 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ARF4P18085 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARF4P18085 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARF4P18085 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARF4P18085 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARF4P18085 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARF4P18085 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ARF4P18085 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARF4P18085 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARF4P18085 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ARF4P18085 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARF4P18085 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ARF4P18085 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARF4P18085 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ARF4P18085 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARF4P18085 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARF4P18085 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARF4P18085 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARF4P18085 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ARF4P18085 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARF4P18085 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARF4P18085 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARF4P18085 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ARF4P18085 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARF4P18085 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARF4P18085 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARF4P18085 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ARF4P18085 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ARF4P18085 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARF4P18085 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARF4P18085 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ARF4P18085 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ARF4P18085 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARF4P18085 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ARF4P18085 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ARF4P18085 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARF4P18085 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARF4P18085 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ARF4P18085 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARF4P18085 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARF4P18085 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARF4P18085 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ARF4P18085 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARF4P18085 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ARF4P18085 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ARF4P18085 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARF4P18085 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARF4P18085 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARF4P18085 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ARF4P18085 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ARF4P18085 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARF4P18085 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ARF4P18085 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARF4P18085 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARF4P18085 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARF4P18085 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ARF4P18085 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARF4P18085 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARF4P18085 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARF4P18085 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARF4P18085 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARF4P18085 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARF4P18085 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARF4P18085 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARF4P18085 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ARF4P18085 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARF4P18085 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARF4P18085 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARF4P18085 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ARF4P18085 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ARF4P18085 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARF4P18085 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARF4P18085 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ARF4P18085 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARF4P18085 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARF4P18085 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ARF4P18085 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARF4P18085 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARF4P18085 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ARF4P18085 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms