Protein–RNA interactions for Protein: P17858

PFKL, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKLP17858 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PFKLP17858 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PFKLP17858 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PFKLP17858 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PFKLP17858 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PFKLP17858 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PFKLP17858 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PFKLP17858 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PFKLP17858 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PFKLP17858 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PFKLP17858 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PFKLP17858 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PFKLP17858 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PFKLP17858 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PFKLP17858 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PFKLP17858 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PFKLP17858 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PFKLP17858 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PFKLP17858 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PFKLP17858 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PFKLP17858 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PFKLP17858 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PFKLP17858 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PFKLP17858 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PFKLP17858 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PFKLP17858 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PFKLP17858 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PFKLP17858 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PFKLP17858 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PFKLP17858 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PFKLP17858 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PFKLP17858 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PFKLP17858 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PFKLP17858 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PFKLP17858 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PFKLP17858 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
PFKLP17858 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PFKLP17858 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PFKLP17858 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PFKLP17858 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PFKLP17858 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PFKLP17858 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PFKLP17858 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PFKLP17858 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PFKLP17858 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PFKLP17858 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PFKLP17858 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PFKLP17858 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PFKLP17858 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PFKLP17858 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PFKLP17858 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PFKLP17858 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PFKLP17858 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PFKLP17858 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PFKLP17858 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PFKLP17858 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PFKLP17858 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PFKLP17858 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PFKLP17858 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PFKLP17858 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PFKLP17858 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PFKLP17858 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PFKLP17858 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PFKLP17858 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PFKLP17858 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PFKLP17858 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PFKLP17858 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PFKLP17858 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PFKLP17858 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PFKLP17858 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PFKLP17858 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PFKLP17858 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PFKLP17858 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PFKLP17858 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PFKLP17858 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PFKLP17858 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PFKLP17858 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PFKLP17858 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PFKLP17858 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PFKLP17858 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PFKLP17858 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PFKLP17858 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PFKLP17858 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PFKLP17858 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PFKLP17858 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PFKLP17858 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PFKLP17858 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PFKLP17858 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PFKLP17858 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PFKLP17858 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PFKLP17858 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PFKLP17858 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PFKLP17858 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PFKLP17858 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PFKLP17858 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PFKLP17858 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PFKLP17858 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PFKLP17858 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PFKLP17858 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PFKLP17858 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms