Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRAFP15056 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRAFP15056 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRAFP15056 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRAFP15056 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRAFP15056 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
BRAFP15056 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRAFP15056 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRAFP15056 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BRAFP15056 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BRAFP15056 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRAFP15056 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BRAFP15056 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRAFP15056 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRAFP15056 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRAFP15056 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRAFP15056 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BRAFP15056 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRAFP15056 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BRAFP15056 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRAFP15056 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BRAFP15056 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRAFP15056 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BRAFP15056 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRAFP15056 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRAFP15056 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRAFP15056 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BRAFP15056 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BRAFP15056 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BRAFP15056 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAFP15056 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAFP15056 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAFP15056 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAFP15056 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAFP15056 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAFP15056 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAFP15056 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BRAFP15056 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRAFP15056 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRAFP15056 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRAFP15056 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BRAFP15056 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRAFP15056 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRAFP15056 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BRAFP15056 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRAFP15056 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRAFP15056 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRAFP15056 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRAFP15056 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAFP15056 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAFP15056 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAFP15056 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAFP15056 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAFP15056 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAFP15056 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BRAFP15056 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BRAFP15056 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRAFP15056 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRAFP15056 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRAFP15056 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRAFP15056 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BRAFP15056 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRAFP15056 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRAFP15056 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRAFP15056 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAFP15056 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAFP15056 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAFP15056 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAFP15056 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAFP15056 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAFP15056 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRAFP15056 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRAFP15056 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRAFP15056 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRAFP15056 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRAFP15056 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRAFP15056 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRAFP15056 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRAFP15056 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRAFP15056 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRAFP15056 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRAFP15056 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRAFP15056 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRAFP15056 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRAFP15056 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRAFP15056 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
BRAFP15056 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRAFP15056 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRAFP15056 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRAFP15056 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRAFP15056 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRAFP15056 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRAFP15056 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRAFP15056 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRAFP15056 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRAFP15056 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRAFP15056 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRAFP15056 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRAFP15056 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRAFP15056 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms