Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DEFA4P12838 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DEFA4P12838 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DEFA4P12838 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DEFA4P12838 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DEFA4P12838 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DEFA4P12838 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DEFA4P12838 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DEFA4P12838 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DEFA4P12838 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA4P12838 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA4P12838 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA4P12838 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA4P12838 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DEFA4P12838 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DEFA4P12838 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DEFA4P12838 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms