Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BCKDHAP12694 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BCKDHAP12694 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BCKDHAP12694 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BCKDHAP12694 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCKDHAP12694 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BCKDHAP12694 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDHAP12694 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDHAP12694 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDHAP12694 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDHAP12694 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDHAP12694 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDHAP12694 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BCKDHAP12694 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCKDHAP12694 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BCKDHAP12694 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms