Protein–RNA interactions for Protein: P12277

CKB, Creatine kinase B-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKBP12277 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CKBP12277 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CKBP12277 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CKBP12277 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CKBP12277 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CKBP12277 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CKBP12277 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CKBP12277 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CKBP12277 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CKBP12277 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CKBP12277 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CKBP12277 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CKBP12277 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CKBP12277 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CKBP12277 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CKBP12277 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CKBP12277 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CKBP12277 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CKBP12277 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CKBP12277 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CKBP12277 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CKBP12277 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CKBP12277 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CKBP12277 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CKBP12277 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CKBP12277 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CKBP12277 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CKBP12277 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CKBP12277 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CKBP12277 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CKBP12277 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CKBP12277 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CKBP12277 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CKBP12277 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CKBP12277 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CKBP12277 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CKBP12277 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CKBP12277 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CKBP12277 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CKBP12277 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CKBP12277 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CKBP12277 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CKBP12277 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CKBP12277 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CKBP12277 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CKBP12277 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CKBP12277 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CKBP12277 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CKBP12277 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CKBP12277 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CKBP12277 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CKBP12277 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CKBP12277 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CKBP12277 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CKBP12277 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CKBP12277 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CKBP12277 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CKBP12277 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CKBP12277 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CKBP12277 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CKBP12277 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CKBP12277 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CKBP12277 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CKBP12277 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CKBP12277 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CKBP12277 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CKBP12277 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CKBP12277 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CKBP12277 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CKBP12277 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CKBP12277 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CKBP12277 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CKBP12277 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CKBP12277 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CKBP12277 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CKBP12277 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CKBP12277 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CKBP12277 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CKBP12277 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CKBP12277 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CKBP12277 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CKBP12277 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CKBP12277 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CKBP12277 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CKBP12277 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CKBP12277 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CKBP12277 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CKBP12277 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CKBP12277 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CKBP12277 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CKBP12277 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CKBP12277 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CKBP12277 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CKBP12277 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CKBP12277 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CKBP12277 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CKBP12277 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CKBP12277 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CKBP12277 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CKBP12277 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms