Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HARSP12081 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HARSP12081 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HARSP12081 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HARSP12081 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HARSP12081 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HARSP12081 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HARSP12081 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HARSP12081 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HARSP12081 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HARSP12081 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HARSP12081 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HARSP12081 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HARSP12081 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HARSP12081 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HARSP12081 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HARSP12081 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HARSP12081 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HARSP12081 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HARSP12081 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HARSP12081 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HARSP12081 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HARSP12081 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HARSP12081 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HARSP12081 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HARSP12081 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HARSP12081 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HARSP12081 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HARSP12081 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HARSP12081 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HARSP12081 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HARSP12081 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HARSP12081 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HARSP12081 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HARSP12081 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HARSP12081 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HARSP12081 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HARSP12081 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HARSP12081 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HARSP12081 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HARSP12081 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HARSP12081 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HARSP12081 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HARSP12081 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HARSP12081 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HARSP12081 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HARSP12081 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HARSP12081 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HARSP12081 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HARSP12081 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HARSP12081 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HARSP12081 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HARSP12081 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HARSP12081 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HARSP12081 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HARSP12081 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HARSP12081 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HARSP12081 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HARSP12081 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HARSP12081 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HARSP12081 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HARSP12081 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HARSP12081 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HARSP12081 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HARSP12081 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HARSP12081 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HARSP12081 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HARSP12081 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HARSP12081 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HARSP12081 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HARSP12081 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HARSP12081 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HARSP12081 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HARSP12081 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HARSP12081 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HARSP12081 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HARSP12081 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HARSP12081 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
HARSP12081 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HARSP12081 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HARSP12081 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HARSP12081 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HARSP12081 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HARSP12081 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HARSP12081 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HARSP12081 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HARSP12081 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HARSP12081 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HARSP12081 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HARSP12081 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HARSP12081 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HARSP12081 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HARSP12081 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HARSP12081 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HARSP12081 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HARSP12081 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HARSP12081 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HARSP12081 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HARSP12081 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HARSP12081 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms