Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNAP12004 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNAP12004 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNAP12004 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNAP12004 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNAP12004 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNAP12004 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCNAP12004 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNAP12004 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNAP12004 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PCNAP12004 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNAP12004 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNAP12004 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNAP12004 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNAP12004 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNAP12004 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNAP12004 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNAP12004 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCNAP12004 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNAP12004 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNAP12004 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNAP12004 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCNAP12004 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNAP12004 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNAP12004 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCNAP12004 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNAP12004 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCNAP12004 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNAP12004 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNAP12004 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNAP12004 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCNAP12004 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCNAP12004 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNAP12004 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNAP12004 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNAP12004 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCNAP12004 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNAP12004 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNAP12004 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNAP12004 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNAP12004 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNAP12004 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNAP12004 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNAP12004 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCNAP12004 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNAP12004 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNAP12004 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNAP12004 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNAP12004 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCNAP12004 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNAP12004 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNAP12004 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCNAP12004 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNAP12004 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNAP12004 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNAP12004 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNAP12004 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNAP12004 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNAP12004 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCNAP12004 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PCNAP12004 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCNAP12004 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCNAP12004 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCNAP12004 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCNAP12004 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCNAP12004 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCNAP12004 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCNAP12004 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCNAP12004 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCNAP12004 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCNAP12004 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCNAP12004 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCNAP12004 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCNAP12004 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PCNAP12004 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCNAP12004 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCNAP12004 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCNAP12004 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCNAP12004 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCNAP12004 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCNAP12004 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCNAP12004 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCNAP12004 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCNAP12004 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCNAP12004 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCNAP12004 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCNAP12004 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCNAP12004 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCNAP12004 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCNAP12004 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCNAP12004 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCNAP12004 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCNAP12004 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCNAP12004 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCNAP12004 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCNAP12004 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCNAP12004 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCNAP12004 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCNAP12004 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCNAP12004 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms