Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP2C9P11712 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CYP2C9P11712 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP2C9P11712 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CYP2C9P11712 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CYP2C9P11712 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP2C9P11712 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP2C9P11712 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP2C9P11712 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CYP2C9P11712 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CYP2C9P11712 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CYP2C9P11712 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CYP2C9P11712 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CYP2C9P11712 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
CYP2C9P11712 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms