Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CGB3P0DN86 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CGB3P0DN86 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CGB3P0DN86 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CGB3P0DN86 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CGB3P0DN86 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CGB3P0DN86 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CGB3P0DN86 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CGB3P0DN86 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CGB3P0DN86 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CGB3P0DN86 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CGB3P0DN86 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CGB3P0DN86 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CGB3P0DN86 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CGB3P0DN86 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CGB3P0DN86 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CGB3P0DN86 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CGB3P0DN86 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CGB3P0DN86 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CGB3P0DN86 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms