Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
U2AF1L5P0DN76 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
U2AF1L5P0DN76 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
U2AF1L5P0DN76 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
U2AF1L5P0DN76 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
U2AF1L5P0DN76 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
U2AF1L5P0DN76 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
U2AF1L5P0DN76 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
U2AF1L5P0DN76 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
U2AF1L5P0DN76 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
U2AF1L5P0DN76 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
U2AF1L5P0DN76 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
U2AF1L5P0DN76 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
U2AF1L5P0DN76 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
U2AF1L5P0DN76 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
U2AF1L5P0DN76 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
U2AF1L5P0DN76 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
U2AF1L5P0DN76 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
U2AF1L5P0DN76 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
U2AF1L5P0DN76 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
U2AF1L5P0DN76 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
U2AF1L5P0DN76 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
U2AF1L5P0DN76 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
U2AF1L5P0DN76 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
U2AF1L5P0DN76 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
U2AF1L5P0DN76 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
U2AF1L5P0DN76 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
U2AF1L5P0DN76 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
U2AF1L5P0DN76 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
U2AF1L5P0DN76 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
U2AF1L5P0DN76 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
U2AF1L5P0DN76 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
U2AF1L5P0DN76 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
U2AF1L5P0DN76 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
U2AF1L5P0DN76 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
U2AF1L5P0DN76 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
U2AF1L5P0DN76 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
U2AF1L5P0DN76 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms