Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB1

PRR23D2, Proline-rich protein 23D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23D2P0DMB1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRR23D2P0DMB1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRR23D2P0DMB1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR23D2P0DMB1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR23D2P0DMB1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms