Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL3P08700 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL3P08700 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL3P08700 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL3P08700 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL3P08700 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IL3P08700 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL3P08700 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL3P08700 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IL3P08700 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IL3P08700 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IL3P08700 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IL3P08700 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IL3P08700 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IL3P08700 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IL3P08700 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IL3P08700 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IL3P08700 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IL3P08700 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IL3P08700 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL3P08700 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL3P08700 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL3P08700 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL3P08700 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL3P08700 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IL3P08700 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IL3P08700 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IL3P08700 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IL3P08700 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IL3P08700 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IL3P08700 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IL3P08700 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IL3P08700 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IL3P08700 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IL3P08700 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IL3P08700 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IL3P08700 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IL3P08700 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IL3P08700 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IL3P08700 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IL3P08700 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IL3P08700 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IL3P08700 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
IL3P08700 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IL3P08700 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IL3P08700 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL3P08700 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL3P08700 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IL3P08700 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IL3P08700 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IL3P08700 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IL3P08700 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IL3P08700 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IL3P08700 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IL3P08700 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IL3P08700 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IL3P08700 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IL3P08700 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IL3P08700 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IL3P08700 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL3P08700 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL3P08700 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL3P08700 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IL3P08700 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IL3P08700 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IL3P08700 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IL3P08700 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IL3P08700 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IL3P08700 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IL3P08700 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IL3P08700 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IL3P08700 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IL3P08700 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IL3P08700 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IL3P08700 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IL3P08700 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IL3P08700 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL3P08700 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL3P08700 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL3P08700 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IL3P08700 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IL3P08700 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IL3P08700 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IL3P08700 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IL3P08700 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IL3P08700 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IL3P08700 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IL3P08700 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IL3P08700 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IL3P08700 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IL3P08700 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IL3P08700 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
IL3P08700 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IL3P08700 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IL3P08700 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
IL3P08700 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
IL3P08700 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IL3P08700 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IL3P08700 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IL3P08700 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms