Protein–RNA interactions for Protein: P08123

COL1A2, Collagen alpha-2(I) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL1A2P08123 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
COL1A2P08123 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL1A2P08123 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
COL1A2P08123 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
COL1A2P08123 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
COL1A2P08123 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
COL1A2P08123 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL1A2P08123 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL1A2P08123 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL1A2P08123 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL1A2P08123 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL1A2P08123 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL1A2P08123 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms