Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CSF1RP07333 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CSF1RP07333 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CSF1RP07333 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CSF1RP07333 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CSF1RP07333 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CSF1RP07333 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CSF1RP07333 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CSF1RP07333 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CSF1RP07333 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CSF1RP07333 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CSF1RP07333 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CSF1RP07333 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CSF1RP07333 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CSF1RP07333 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CSF1RP07333 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CSF1RP07333 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CSF1RP07333 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CSF1RP07333 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.8 ms