Protein–RNA interactions for Protein: P07202

TPO, Thyroid peroxidase, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPOP07202 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPOP07202 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPOP07202 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPOP07202 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TPOP07202 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPOP07202 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPOP07202 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TPOP07202 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPOP07202 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TPOP07202 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPOP07202 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPOP07202 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TPOP07202 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TPOP07202 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TPOP07202 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPOP07202 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPOP07202 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPOP07202 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPOP07202 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TPOP07202 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPOP07202 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPOP07202 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TPOP07202 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TPOP07202 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TPOP07202 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPOP07202 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPOP07202 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPOP07202 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TPOP07202 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPOP07202 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPOP07202 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPOP07202 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TPOP07202 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPOP07202 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TPOP07202 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPOP07202 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPOP07202 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TPOP07202 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPOP07202 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPOP07202 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPOP07202 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPOP07202 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPOP07202 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPOP07202 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPOP07202 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPOP07202 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPOP07202 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPOP07202 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TPOP07202 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPOP07202 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPOP07202 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TPOP07202 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TPOP07202 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPOP07202 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TPOP07202 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPOP07202 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPOP07202 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPOP07202 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPOP07202 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPOP07202 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPOP07202 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPOP07202 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPOP07202 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPOP07202 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPOP07202 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPOP07202 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TPOP07202 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPOP07202 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPOP07202 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPOP07202 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPOP07202 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPOP07202 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPOP07202 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPOP07202 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPOP07202 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPOP07202 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPOP07202 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPOP07202 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPOP07202 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPOP07202 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPOP07202 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPOP07202 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPOP07202 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPOP07202 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPOP07202 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPOP07202 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPOP07202 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPOP07202 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPOP07202 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPOP07202 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPOP07202 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPOP07202 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TPOP07202 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPOP07202 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPOP07202 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPOP07202 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPOP07202 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPOP07202 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPOP07202 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TPOP07202 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms