Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYL1P05976 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYL1P05976 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYL1P05976 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYL1P05976 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYL1P05976 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MYL1P05976 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYL1P05976 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYL1P05976 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYL1P05976 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYL1P05976 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MYL1P05976 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYL1P05976 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYL1P05976 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYL1P05976 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYL1P05976 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYL1P05976 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYL1P05976 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYL1P05976 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYL1P05976 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYL1P05976 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYL1P05976 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYL1P05976 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYL1P05976 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYL1P05976 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MYL1P05976 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MYL1P05976 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYL1P05976 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYL1P05976 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYL1P05976 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYL1P05976 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYL1P05976 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MYL1P05976 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYL1P05976 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYL1P05976 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYL1P05976 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYL1P05976 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYL1P05976 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYL1P05976 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYL1P05976 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYL1P05976 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYL1P05976 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYL1P05976 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYL1P05976 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYL1P05976 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MYL1P05976 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MYL1P05976 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYL1P05976 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYL1P05976 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYL1P05976 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MYL1P05976 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYL1P05976 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYL1P05976 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MYL1P05976 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYL1P05976 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MYL1P05976 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MYL1P05976 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MYL1P05976 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYL1P05976 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MYL1P05976 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MYL1P05976 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MYL1P05976 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MYL1P05976 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYL1P05976 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYL1P05976 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYL1P05976 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYL1P05976 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYL1P05976 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYL1P05976 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MYL1P05976 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYL1P05976 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYL1P05976 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYL1P05976 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYL1P05976 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MYL1P05976 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
MYL1P05976 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYL1P05976 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MYL1P05976 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYL1P05976 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MYL1P05976 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MYL1P05976 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MYL1P05976 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MYL1P05976 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYL1P05976 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYL1P05976 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYL1P05976 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYL1P05976 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MYL1P05976 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MYL1P05976 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYL1P05976 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYL1P05976 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MYL1P05976 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYL1P05976 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYL1P05976 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYL1P05976 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MYL1P05976 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYL1P05976 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYL1P05976 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYL1P05976 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MYL1P05976 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms