Protein–RNA interactions for Protein: O96017

CHEK2, Serine/threonine-protein kinase Chk2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHEK2O96017 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHEK2O96017 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHEK2O96017 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHEK2O96017 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHEK2O96017 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHEK2O96017 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHEK2O96017 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHEK2O96017 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHEK2O96017 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHEK2O96017 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHEK2O96017 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHEK2O96017 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHEK2O96017 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CHEK2O96017 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHEK2O96017 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHEK2O96017 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHEK2O96017 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHEK2O96017 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHEK2O96017 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHEK2O96017 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHEK2O96017 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms