Protein–RNA interactions for Protein: O96013

PAK4, Serine/threonine-protein kinase PAK 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK4O96013 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PAK4O96013 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAK4O96013 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAK4O96013 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PAK4O96013 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAK4O96013 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAK4O96013 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PAK4O96013 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PAK4O96013 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PAK4O96013 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAK4O96013 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PAK4O96013 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAK4O96013 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAK4O96013 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAK4O96013 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PAK4O96013 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PAK4O96013 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAK4O96013 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAK4O96013 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAK4O96013 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PAK4O96013 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAK4O96013 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAK4O96013 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PAK4O96013 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PAK4O96013 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAK4O96013 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAK4O96013 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAK4O96013 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAK4O96013 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAK4O96013 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAK4O96013 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAK4O96013 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAK4O96013 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAK4O96013 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAK4O96013 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PAK4O96013 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAK4O96013 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAK4O96013 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAK4O96013 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PAK4O96013 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAK4O96013 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAK4O96013 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAK4O96013 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PAK4O96013 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PAK4O96013 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAK4O96013 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAK4O96013 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAK4O96013 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAK4O96013 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAK4O96013 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAK4O96013 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PAK4O96013 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PAK4O96013 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PAK4O96013 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PAK4O96013 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAK4O96013 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAK4O96013 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAK4O96013 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAK4O96013 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PAK4O96013 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAK4O96013 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAK4O96013 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAK4O96013 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAK4O96013 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAK4O96013 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAK4O96013 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAK4O96013 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAK4O96013 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAK4O96013 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAK4O96013 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAK4O96013 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAK4O96013 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAK4O96013 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAK4O96013 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAK4O96013 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAK4O96013 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PAK4O96013 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAK4O96013 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAK4O96013 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAK4O96013 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAK4O96013 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAK4O96013 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAK4O96013 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAK4O96013 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAK4O96013 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK4O96013 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK4O96013 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK4O96013 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK4O96013 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAK4O96013 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAK4O96013 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAK4O96013 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAK4O96013 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK4O96013 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK4O96013 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK4O96013 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK4O96013 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PAK4O96013 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAK4O96013 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAK4O96013 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms