Protein–RNA interactions for Protein: O95389

WISP3, WNT1-inducible-signaling pathway protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WISP3O95389 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WISP3O95389 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WISP3O95389 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
WISP3O95389 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WISP3O95389 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WISP3O95389 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WISP3O95389 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
WISP3O95389 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WISP3O95389 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WISP3O95389 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WISP3O95389 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WISP3O95389 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WISP3O95389 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WISP3O95389 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WISP3O95389 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
WISP3O95389 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WISP3O95389 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WISP3O95389 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WISP3O95389 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WISP3O95389 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WISP3O95389 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WISP3O95389 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
WISP3O95389 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WISP3O95389 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
WISP3O95389 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WISP3O95389 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
WISP3O95389 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
WISP3O95389 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
WISP3O95389 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
WISP3O95389 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
WISP3O95389 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WISP3O95389 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WISP3O95389 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WISP3O95389 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
WISP3O95389 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
WISP3O95389 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WISP3O95389 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WISP3O95389 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WISP3O95389 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WISP3O95389 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WISP3O95389 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WISP3O95389 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WISP3O95389 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
WISP3O95389 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WISP3O95389 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
WISP3O95389 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WISP3O95389 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WISP3O95389 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
WISP3O95389 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WISP3O95389 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WISP3O95389 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
WISP3O95389 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
WISP3O95389 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
WISP3O95389 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WISP3O95389 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WISP3O95389 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WISP3O95389 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WISP3O95389 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WISP3O95389 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
WISP3O95389 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WISP3O95389 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WISP3O95389 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
WISP3O95389 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
WISP3O95389 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
WISP3O95389 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WISP3O95389 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
WISP3O95389 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WISP3O95389 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WISP3O95389 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
WISP3O95389 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WISP3O95389 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WISP3O95389 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WISP3O95389 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
WISP3O95389 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WISP3O95389 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
WISP3O95389 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WISP3O95389 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
WISP3O95389 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WISP3O95389 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WISP3O95389 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WISP3O95389 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
WISP3O95389 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
WISP3O95389 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WISP3O95389 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WISP3O95389 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
WISP3O95389 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WISP3O95389 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
WISP3O95389 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WISP3O95389 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
WISP3O95389 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WISP3O95389 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WISP3O95389 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WISP3O95389 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WISP3O95389 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
WISP3O95389 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WISP3O95389 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WISP3O95389 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WISP3O95389 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WISP3O95389 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
WISP3O95389 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms