Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCELO95171 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCELO95171 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCELO95171 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCELO95171 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCELO95171 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCELO95171 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SCELO95171 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCELO95171 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SCELO95171 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCELO95171 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SCELO95171 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCELO95171 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCELO95171 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCELO95171 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SCELO95171 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SCELO95171 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SCELO95171 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SCELO95171 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCELO95171 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCELO95171 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCELO95171 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SCELO95171 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCELO95171 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCELO95171 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCELO95171 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SCELO95171 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCELO95171 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCELO95171 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCELO95171 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCELO95171 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCELO95171 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCELO95171 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCELO95171 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCELO95171 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCELO95171 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCELO95171 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCELO95171 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCELO95171 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCELO95171 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCELO95171 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCELO95171 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCELO95171 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCELO95171 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCELO95171 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCELO95171 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCELO95171 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCELO95171 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCELO95171 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCELO95171 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCELO95171 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCELO95171 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCELO95171 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCELO95171 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCELO95171 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCELO95171 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCELO95171 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCELO95171 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCELO95171 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCELO95171 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCELO95171 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCELO95171 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCELO95171 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCELO95171 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCELO95171 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCELO95171 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCELO95171 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCELO95171 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCELO95171 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCELO95171 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCELO95171 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCELO95171 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCELO95171 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCELO95171 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCELO95171 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCELO95171 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCELO95171 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCELO95171 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCELO95171 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCELO95171 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCELO95171 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCELO95171 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCELO95171 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCELO95171 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCELO95171 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCELO95171 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCELO95171 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCELO95171 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCELO95171 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCELO95171 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCELO95171 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCELO95171 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCELO95171 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCELO95171 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCELO95171 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCELO95171 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCELO95171 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCELO95171 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCELO95171 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCELO95171 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms