Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LGR5O75473 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LGR5O75473 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LGR5O75473 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LGR5O75473 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
LGR5O75473 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LGR5O75473 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LGR5O75473 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LGR5O75473 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LGR5O75473 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LGR5O75473 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LGR5O75473 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LGR5O75473 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LGR5O75473 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LGR5O75473 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LGR5O75473 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LGR5O75473 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LGR5O75473 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LGR5O75473 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LGR5O75473 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LGR5O75473 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LGR5O75473 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LGR5O75473 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LGR5O75473 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LGR5O75473 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LGR5O75473 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LGR5O75473 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LGR5O75473 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LGR5O75473 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LGR5O75473 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LGR5O75473 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LGR5O75473 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LGR5O75473 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
LGR5O75473 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
LGR5O75473 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LGR5O75473 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LGR5O75473 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
LGR5O75473 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
LGR5O75473 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LGR5O75473 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LGR5O75473 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LGR5O75473 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LGR5O75473 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LGR5O75473 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LGR5O75473 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LGR5O75473 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LGR5O75473 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LGR5O75473 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LGR5O75473 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LGR5O75473 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LGR5O75473 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LGR5O75473 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LGR5O75473 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LGR5O75473 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LGR5O75473 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LGR5O75473 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LGR5O75473 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LGR5O75473 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LGR5O75473 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LGR5O75473 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
LGR5O75473 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LGR5O75473 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LGR5O75473 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LGR5O75473 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LGR5O75473 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LGR5O75473 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
LGR5O75473 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LGR5O75473 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
LGR5O75473 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LGR5O75473 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LGR5O75473 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LGR5O75473 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LGR5O75473 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LGR5O75473 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LGR5O75473 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LGR5O75473 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LGR5O75473 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LGR5O75473 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LGR5O75473 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LGR5O75473 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LGR5O75473 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LGR5O75473 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LGR5O75473 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LGR5O75473 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LGR5O75473 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LGR5O75473 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LGR5O75473 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LGR5O75473 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LGR5O75473 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LGR5O75473 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LGR5O75473 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LGR5O75473 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LGR5O75473 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LGR5O75473 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LGR5O75473 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LGR5O75473 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LGR5O75473 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LGR5O75473 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LGR5O75473 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LGR5O75473 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms