Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 FARP1-224ENST00000598389 747 ntTSL 56.21□□□□□ -1.422e-7■■■■■ 71.6
DKC1O60832 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.893e-13■■■■■ 71.2
DKC1O60832 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.652e-21■■■■■ 71
DKC1O60832 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.652e-21■■■■■ 71
DKC1O60832 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.792e-21■■■■■ 71
DKC1O60832 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.72e-21■■■■■ 71
DKC1O60832 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.42e-7■■■■■ 70.9
DKC1O60832 LRP5-206ENST00000529993 5103 ntTSL 1 (best)16.44■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 70.9
DKC1O60832 ETV5-203ENST00000421809 554 ntTSL 223.27■■□□□ 1.324e-6■■■■■ 70.9
DKC1O60832 ETV5-210ENST00000476890 642 ntTSL 221.62■■□□□ 1.054e-6■■■■■ 70.9
DKC1O60832 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.34e-6■■■■■ 70.9
DKC1O60832 ETV5-204ENST00000422039 564 ntTSL 414.34□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 70.9
DKC1O60832 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 70.9
DKC1O60832 ETV5-207ENST00000440773 574 ntTSL 46.93□□□□□ -1.34e-6■■■■■ 70.9
DKC1O60832 ETV5-202ENST00000413301 573 ntTSL 46.85□□□□□ -1.314e-6■■■■■ 70.9
DKC1O60832 ETV5-208ENST00000472868 238 ntTSL 52.86□□□□□ -1.954e-6■■■■■ 70.9
DKC1O60832 SPSB1-204ENST00000450402 822 ntTSL 517.47■□□□□ 0.399e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-7■■■■■ 70.8
DKC1O60832 AC009119.2-202ENST00000563312 458 ntTSL 215.64■□□□□ 0.099e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.079e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 MLYCD-201ENST00000262430 13038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.689e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 VPS13D-212ENST00000543766 3838 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.929e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 VPS13D-211ENST00000543710 5676 ntTSL 1 (best)8.81□□□□□ -19e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 VPS13D-201ENST00000011700 10969 ntTSL 1 (best)6.87□□□□□ -1.319e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 AC009119.2-203ENST00000566309 583 ntTSL 26.07□□□□□ -1.449e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.529e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.549e-16■■■■■ 70.8
DKC1O60832 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.089e-10■■■■■ 70.7
DKC1O60832 ASGR2-201ENST00000254850 1396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.079e-10■■■■■ 70.7
DKC1O60832 ASGR2-202ENST00000355035 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.079e-10■■■■■ 70.7
DKC1O60832 LDLRAD4-212ENST00000587905 743 ntTSL 522.89■■□□□ 1.252e-7■■■■■ 70.6
DKC1O60832 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 70.6
DKC1O60832 PTPN4-207ENST00000460162 623 ntTSL 425.57■■□□□ 1.684e-16■■■■■ 70.3
DKC1O60832 PTPN4-202ENST00000420482 568 ntTSL 424.01■■□□□ 1.434e-16■■■■■ 70.3
DKC1O60832 SYNE3-205ENST00000557275 13488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.841e-9■■■■■ 70.1
DKC1O60832 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.254e-7■■■■■ 69.9
DKC1O60832 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 516.33■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 69.9
DKC1O60832 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.044e-7■■■■■ 69.9
DKC1O60832 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.477e-7■■■■■ 69.8
DKC1O60832 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.437e-7■■■■■ 69.8
DKC1O60832 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 69.8
DKC1O60832 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 69.8
DKC1O60832 BAIAP2-206ENST00000570913 559 ntTSL 417.22■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 69.7
DKC1O60832 VWCE-203ENST00000398808 717 ntTSL 317.56■□□□□ 0.42e-8■■■■■ 69.6
DKC1O60832 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 69.6
DKC1O60832 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.275e-23■■■■■ 69.3
DKC1O60832 MED24-214ENST00000535508 3334 ntTSL 213.17□□□□□ -0.35e-23■■■■■ 69.3
DKC1O60832 MED24-201ENST00000356271 3446 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.385e-23■■■■■ 69.3
DKC1O60832 MED24-203ENST00000394127 3456 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.425e-23■■■■■ 69.3
DKC1O60832 MED24-202ENST00000394126 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.65e-23■■■■■ 69.3
DKC1O60832 MED24-234ENST00000614384 454 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.975e-23■■■■■ 69.3
DKC1O60832 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.464e-69■■■■■ 69.3
DKC1O60832 SRGAP2C-202ENST00000367123 7204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.594e-69■■■■■ 69.3
DKC1O60832 FOXN3-212ENST00000556541 388 ntTSL 312.68□□□□□ -0.387e-30■■■■■ 69
DKC1O60832 FOXN3-216ENST00000557496 228 ntTSL 51.14□□□□□ -2.237e-30■■■■■ 69
DKC1O60832 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.086e-7■■■■■ 68.9
DKC1O60832 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 68.7
DKC1O60832 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 68.7
DKC1O60832 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 68.7
DKC1O60832 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.161e-6■■■■■ 68.7
DKC1O60832 PRDM16-207ENST00000512462 3723 ntTSL 1 (best)12.84□□□□□ -0.351e-6■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-212ENST00000529728 1396 ntTSL 528.23■■■□□ 2.113e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-214ENST00000530925 793 ntTSL 325.52■■□□□ 1.683e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.573e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-213ENST00000530613 893 ntTSL 524.66■■□□□ 1.543e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-207ENST00000527494 1314 ntTSL 524.18■■□□□ 1.463e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-223ENST00000533328 541 ntTSL 523.72■■□□□ 1.393e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-218ENST00000532212 622 ntTSL 323.72■■□□□ 1.393e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-220ENST00000532389 833 ntTSL 523.63■■□□□ 1.373e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.023e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-205ENST00000525422 1525 ntTSL 1 (best)19.09■□□□□ 0.653e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.123e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 FOXN2-202ENST00000413569 932 ntTSL 315.47■□□□□ 0.073e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 TANGO6-210ENST00000568361 622 ntTSL 214.15□□□□□ -0.143e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 TANGO6-205ENST00000562000 542 ntTSL 413.68□□□□□ -0.223e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 TANGO6-204ENST00000561931 585 ntTSL 313.14□□□□□ -0.313e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 TANGO6-201ENST00000261778 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.653e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 SERGEF-203ENST00000524716 548 ntTSL 410.91□□□□□ -0.663e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.113e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.423e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.443e-15■■■■■ 68.7
DKC1O60832 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.341e-16■■■■■ 68.3
DKC1O60832 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.691e-16■■■■■ 68.3
DKC1O60832 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.311e-323■■■■■ 67.8
DKC1O60832 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.51□□□□□ -1.851e-323■■■■■ 67.8
DKC1O60832 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.569e-11■■■■■ 67.6
DKC1O60832 PVT1-203ENST00000513868 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.148e-8■■■■■ 67.5
DKC1O60832 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.274e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.074e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.674e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.14e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-209ENST00000474308 1854 ntTSL 221.24■□□□□ 0.994e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.824e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.684e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.434e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-215ENST00000494454 2004 ntTSL 1 (best)17.32■□□□□ 0.364e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-210ENST00000475995 751 ntTSL 517.01■□□□□ 0.314e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 TXNRD2-221ENST00000635155 858 ntTSL 515.43■□□□□ 0.064e-9■■■■■ 67.4
DKC1O60832 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC1.8□□□□□ -2.123e-48■■■■■ 67.1
DKC1O60832 DKC1-212ENST00000492372 406 ntTSL 29.69□□□□□ -0.861e-323■■■■■ 67.1
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