RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398808.3

VWCE-203, Transcript of von Willebrand factor C and EGF domains, humanhuman

TSL 3

Gene VWCE, Length 717 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCE-203ENST00000398808 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.54■■■■□ 3.92
VWCE-203ENST00000398808 ABCC9O60706 1549 aa35.56■■■■□ 3.28
VWCE-203ENST00000398808 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.53■■■■□ 3.28
VWCE-203ENST00000398808 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.85■■■■□ 3.01
VWCE-203ENST00000398808 NACADO15069 1562 aa33.63■■■□□ 2.97
VWCE-203ENST00000398808 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.48■■■□□ 2.95
VWCE-203ENST00000398808 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.32■■■□□ 2.92
VWCE-203ENST00000398808 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.18■■■□□ 2.9
VWCE-203ENST00000398808 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.09■■■□□ 2.89
VWCE-203ENST00000398808 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.06■■■□□ 2.88
VWCE-203ENST00000398808 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.88■■■□□ 2.85
VWCE-203ENST00000398808 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.74■■■□□ 2.83
VWCE-203ENST00000398808 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.71■■■□□ 2.83
VWCE-203ENST00000398808 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.48■■■□□ 2.79
VWCE-203ENST00000398808 SCRIBQ14160 1630 aa32.29■■■□□ 2.76
VWCE-203ENST00000398808 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.15■■■□□ 2.74
VWCE-203ENST00000398808 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.08■■■□□ 2.73
VWCE-203ENST00000398808 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
VWCE-203ENST00000398808 NCAPD3P42695 1498 aa31.06■■■□□ 2.56
VWCE-203ENST00000398808 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.92■■■□□ 2.54
VWCE-203ENST00000398808 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.86■■■□□ 2.53
VWCE-203ENST00000398808 SMARCA4P51532 1647 aa30.84■■■□□ 2.53
VWCE-203ENST00000398808 SMARCA2P51531 1590 aa30.83■■■□□ 2.53
VWCE-203ENST00000398808 HMGXB3Q12766 1538 aa30.79■■■□□ 2.52
VWCE-203ENST00000398808 CUX2O14529 1486 aa30.76■■■□□ 2.51
VWCE-203ENST00000398808 ERCC6Q03468 1493 aa30.71■■■□□ 2.51
VWCE-203ENST00000398808 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.69■■■□□ 2.5
VWCE-203ENST00000398808 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.59■■■□□ 2.49
VWCE-203ENST00000398808 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.58■■■□□ 2.49
VWCE-203ENST00000398808 NESP48681 1621 aa30.53■■■□□ 2.48
VWCE-203ENST00000398808 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.44■■■□□ 2.46
VWCE-203ENST00000398808 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.34■■■□□ 2.45
VWCE-203ENST00000398808 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
VWCE-203ENST00000398808 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.18■■■□□ 2.42
VWCE-203ENST00000398808 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.13■■■□□ 2.41
VWCE-203ENST00000398808 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.09■■■□□ 2.41
VWCE-203ENST00000398808 WIZO95785 1651 aa30.05■■■□□ 2.4
VWCE-203ENST00000398808 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.9■■■□□ 2.38
VWCE-203ENST00000398808 WDR62O43379 1518 aa29.85■■■□□ 2.37
VWCE-203ENST00000398808 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
VWCE-203ENST00000398808 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.75■■■□□ 2.35
VWCE-203ENST00000398808 CFTRP13569 1480 aa29.74■■■□□ 2.35
VWCE-203ENST00000398808 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.72■■■□□ 2.35
VWCE-203ENST00000398808 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.7■■■□□ 2.34
VWCE-203ENST00000398808 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
VWCE-203ENST00000398808 PRDM2Q13029 1718 aa29.4■■■□□ 2.3
VWCE-203ENST00000398808 TRIM41Q8WV44 630 aa29.37■■■□□ 2.29
VWCE-203ENST00000398808 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.36■■■□□ 2.29
VWCE-203ENST00000398808 OSCARQ8IYS5 282 aa29.33■■■□□ 2.29
VWCE-203ENST00000398808 IFT140Q96RY7 1462 aa29.19■■■□□ 2.26
VWCE-203ENST00000398808 TOPBP1Q92547 1522 aa29.15■■■□□ 2.26
VWCE-203ENST00000398808 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
VWCE-203ENST00000398808 ABCC8Q09428 1581 aa29.12■■■□□ 2.25
VWCE-203ENST00000398808 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.04■■■□□ 2.24
VWCE-203ENST00000398808 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
VWCE-203ENST00000398808 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.92■■■□□ 2.22
VWCE-203ENST00000398808 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.92■■■□□ 2.22
VWCE-203ENST00000398808 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.92■■■□□ 2.22
VWCE-203ENST00000398808 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.91■■■□□ 2.22
VWCE-203ENST00000398808 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.85■■■□□ 2.211e-6■■■■■ 31.6
VWCE-203ENST00000398808 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
VWCE-203ENST00000398808 ARHGEF11O15085 1522 aa28.83■■■□□ 2.21
VWCE-203ENST00000398808 CHD1O14646 1710 aa28.74■■■□□ 2.19
VWCE-203ENST00000398808 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.72■■■□□ 2.19
VWCE-203ENST00000398808 SOGA1O94964 1423 aa28.71■■■□□ 2.19
VWCE-203ENST00000398808 WDR97A6NE52 1622 aa28.65■■■□□ 2.18
VWCE-203ENST00000398808 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
VWCE-203ENST00000398808 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.64■■■□□ 2.17
VWCE-203ENST00000398808 FBLN2P98095 1184 aa28.63■■■□□ 2.17
VWCE-203ENST00000398808 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.61■■■□□ 2.17
VWCE-203ENST00000398808 CUX1P39880 1505 aa28.6■■■□□ 2.17
VWCE-203ENST00000398808 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.54■■■□□ 2.16
VWCE-203ENST00000398808 ARAP1Q96P48 1450 aa28.54■■■□□ 2.16
VWCE-203ENST00000398808 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
VWCE-203ENST00000398808 GRIN2BQ13224 1484 aa28.48■■■□□ 2.15
VWCE-203ENST00000398808 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
VWCE-203ENST00000398808 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.45■■■□□ 2.15
VWCE-203ENST00000398808 SYNJ1O43426 1573 aa28.42■■■□□ 2.14
VWCE-203ENST00000398808 SYNJ2O15056 1496 aa28.4■■■□□ 2.14
VWCE-203ENST00000398808 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.36■■■□□ 2.13
VWCE-203ENST00000398808 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.34■■■□□ 2.13
VWCE-203ENST00000398808 PBRM1Q86U86 1689 aa28.33■■■□□ 2.13
VWCE-203ENST00000398808 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
VWCE-203ENST00000398808 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
VWCE-203ENST00000398808 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.29■■■□□ 2.12
VWCE-203ENST00000398808 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.19■■■□□ 2.1
VWCE-203ENST00000398808 TOP2BQ02880 1626 aa28.14■■■□□ 2.09
VWCE-203ENST00000398808 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.14■■■□□ 2.09
VWCE-203ENST00000398808 GRIN2AQ12879 1464 aa28.1■■■□□ 2.09
VWCE-203ENST00000398808 ADAMTS12P58397 1594 aa28.07■■■□□ 2.08
VWCE-203ENST00000398808 NUP160Q12769 1436 aa28.05■■■□□ 2.08
VWCE-203ENST00000398808 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.01■■■□□ 2.08
VWCE-203ENST00000398808 CEP170Q5SW79 1584 aa28■■■□□ 2.07
VWCE-203ENST00000398808 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.99■■■□□ 2.07
VWCE-203ENST00000398808 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.97■■■□□ 2.07
VWCE-203ENST00000398808 SHROOM2Q13796 1616 aa27.92■■■□□ 2.06
VWCE-203ENST00000398808 JPH4Q96JJ6 628 aa27.75■■■□□ 2.03
VWCE-203ENST00000398808 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.75■■■□□ 2.03
VWCE-203ENST00000398808 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.67■■■□□ 2.02
VWCE-203ENST00000398808 IGF1RP08069 1367 aa27.6■■■□□ 2.01
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