Protein–RNA interactions for Protein: O00629

KPNA4, Importin subunit alpha-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA4O00629 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KPNA4O00629 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KPNA4O00629 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KPNA4O00629 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KPNA4O00629 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KPNA4O00629 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms