Protein–RNA interactions for Protein: O00505

KPNA3, Importin subunit alpha-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA3O00505 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KPNA3O00505 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KPNA3O00505 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KPNA3O00505 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KPNA3O00505 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KPNA3O00505 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KPNA3O00505 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KPNA3O00505 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KPNA3O00505 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KPNA3O00505 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KPNA3O00505 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KPNA3O00505 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KPNA3O00505 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KPNA3O00505 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KPNA3O00505 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KPNA3O00505 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KPNA3O00505 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KPNA3O00505 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KPNA3O00505 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KPNA3O00505 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KPNA3O00505 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KPNA3O00505 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KPNA3O00505 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KPNA3O00505 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KPNA3O00505 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KPNA3O00505 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KPNA3O00505 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KPNA3O00505 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KPNA3O00505 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KPNA3O00505 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KPNA3O00505 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
KPNA3O00505 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA3O00505 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA3O00505 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms