Protein–RNA interactions for Protein: A8MX34

KRTAP29-1, Keratin-associated protein 29-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP29-1A8MX34 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
KRTAP29-1A8MX34 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
KRTAP29-1A8MX34 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KRTAP29-1A8MX34 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
KRTAP29-1A8MX34 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms