Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRRM3A6NNA2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRRM3A6NNA2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRRM3A6NNA2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRRM3A6NNA2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRRM3A6NNA2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRRM3A6NNA2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRRM3A6NNA2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRRM3A6NNA2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRRM3A6NNA2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRRM3A6NNA2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SRRM3A6NNA2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRRM3A6NNA2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRRM3A6NNA2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRRM3A6NNA2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRRM3A6NNA2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SRRM3A6NNA2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRRM3A6NNA2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRRM3A6NNA2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRRM3A6NNA2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRRM3A6NNA2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRRM3A6NNA2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SRRM3A6NNA2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SRRM3A6NNA2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRRM3A6NNA2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SRRM3A6NNA2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRRM3A6NNA2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SRRM3A6NNA2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRRM3A6NNA2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SRRM3A6NNA2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SRRM3A6NNA2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SRRM3A6NNA2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms