Protein–RNA interactions for Protein: A6NLU5

VSTM2B, V-set and transmembrane domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2BA6NLU5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VSTM2BA6NLU5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VSTM2BA6NLU5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VSTM2BA6NLU5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VSTM2BA6NLU5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VSTM2BA6NLU5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms