Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HELTA6NFD8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HELTA6NFD8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HELTA6NFD8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
HELTA6NFD8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms