Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6CA6NDK9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6CA6NDK9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GOLGA6CA6NDK9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GOLGA6CA6NDK9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GOLGA6CA6NDK9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms