Protein–RNA interactions for Protein: A6NCC3

GOLGA8O, Golgin subfamily A member 8O, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8OA6NCC3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms