Protein–RNA interactions for Protein: A6NCC3

GOLGA8O, Golgin subfamily A member 8O, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8OA6NCC3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GOLGA8OA6NCC3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GOLGA8OA6NCC3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GOLGA8OA6NCC3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GOLGA8OA6NCC3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms