Protein–RNA interactions for Protein: A0A1W2PQU0

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1W2PQU0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
A0A1W2PQU0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
A0A1W2PQU0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
A0A1W2PQU0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
A0A1W2PQU0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A1W2PQU0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A1W2PQU0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A1W2PQU0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A1W2PQU0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
A0A1W2PQU0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
A0A1W2PQU0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms