Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRBV6-7A0A0A0MS04 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRBV6-7A0A0A0MS04 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRBV6-7A0A0A0MS04 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV6-7A0A0A0MS04 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV6-7A0A0A0MS04 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV6-7A0A0A0MS04 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV6-7A0A0A0MS04 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV6-7A0A0A0MS04 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV6-7A0A0A0MS04 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRBV6-7A0A0A0MS04 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV6-7A0A0A0MS04 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV6-7A0A0A0MS04 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV6-7A0A0A0MS04 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV6-7A0A0A0MS04 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV6-7A0A0A0MS04 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV6-7A0A0A0MS04 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRBV6-7A0A0A0MS04 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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