Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 L3MBTL3-204ENST00000526019 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SMARCA2-263ENST00000637806 7061 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SPARC-201ENST00000231061 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008764.9-201ENST00000624284 2505 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ACSBG1-201ENST00000258873 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CDH8-211ENST00000584337 3986 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ACOT9-202ENST00000379295 2768 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MARS2-201ENST00000282276 3019 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TWF1-211ENST00000552521 3012 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 C10orf105-201ENST00000398786 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NLRP2-209ENST00000537859 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MS4A15-202ENST00000405633 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LDLRAD3-201ENST00000315571 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 GUCY1A3-202ENST00000393832 4286 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 KLLN-201ENST00000445946 4277 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CICP2-201ENST00000420675 2328 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF133-214ENST00000628216 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CICP18-201ENST00000406017 2812 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AP005264.8-201ENST00000623093 3313 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKRD42-202ENST00000393389 4066 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TXNDC16-201ENST00000281741 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC144A-204ENST00000360524 5830 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SHPRH-201ENST00000275233 6649 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01104-202ENST00000452354 3115 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TENM3-204ENST00000511685 10896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 VDR-206ENST00000549336 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 DGKB-206ENST00000407950 3651 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZDHHC22-201ENST00000319374 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SH3YL1-202ENST00000402632 3151 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 TTC30A-201ENST00000355689 5975 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 STIL-202ENST00000360380 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MPP4-202ENST00000359962 2436 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AFAP1L2-201ENST00000304129 3705 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 BCL2L13-201ENST00000317582 2992 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 RUFY4-202ENST00000374155 2977 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 INSC-201ENST00000379554 2954 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CSTF1-201ENST00000217109 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 GOLGA2-201ENST00000421699 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 GOLGA2-214ENST00000611957 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF17-201ENST00000307658 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 USP13-203ENST00000496897 2747 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZSCAN26-206ENST00000619937 2729 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MAPKBP1-201ENST00000456763 7158 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MRPL22-201ENST00000265229 3035 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 MYO18B-205ENST00000536101 8051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AK2-202ENST00000373449 3586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NRXN1-248ENST00000636345 3595 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 FOXD2-AS1-201ENST00000445551 2509 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
KRTAP9-9Q9BYP9 NPC1L1-202ENST00000381160 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms