Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS61

KCNIP2, Kv channel-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP2Q9NS61 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP2Q9NS61 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP2Q9NS61 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms