Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C20orf27Q9GZN8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms